Az Egyetem Főtitkársága a román, a magyar és a német tagozat szintjén fejti ki tevékenységét, külön személyzettel és szervezeti felépítéssel. Az Egyetem Főtitkárságának irodái, hivatalai és osztályai az Igazgatótanács által kidolgozott szabályzat szerint működnek, és ezek tevékenysége az illetékes rektorhelyettesek alárendeltségébe tartozik, szervezeti szempontból pedig az egyetem rektorának alárendeltjei.
A Főtitkárság biztosítja a Szenátus és az Igazgatótanács stratégiai döntéseinek gyakorlatba ültetését, az érvényben lévő szabályozásokkal összhangban.
Oktatásügyi kérdésekben biztosítja a kapcsolatot a MENCS (Oktatási és Tudományos Kutatási Minisztérium, ARACIS (a Romániai Felsőoktatás Minőségét Ellenőrző Bizottság), CNFIS (a Felsőoktatás Finanszírozásának Országos Tanácsa), CNCSIS (a Felsőoktatási Tudományos Kutatás Országos Tanácsa), INS (Országos Statisztikai Intézet) illetékes ügyosztályaival, az Egyetem vezetőségének mandátumával összhangban.
Biztosítja egyfelől az egyetem és a rektorhelyettesi hivatalok, karok, adminisztratív szolgáltatások közötti kapcsolódást, másfelől kapcsolatot tart az oktatókkal, hallgatókkal, egyetemi alkalmazottakkal, az egyetemi arculat megszilárdításának céljával.